Biyodizel kullanımını özelikle lüks otomobil üreticileri tarafından motora zarar verdiği gerekçesiyle tavsiye edilmiyor. Bilindiği gibi bitkisel kökenli yakıt olan biyodizel egzoz emisyonlarını hatırı sayılır derecede düşürüyor. Ancak buna rağmen yakıt sisteminde ki parçalarara (enjektör vs) zarar veriyor. Avrupa birliğininde bu konuda biyodizel kullanımını standartlaştırmaya yönelik çalışmaları mevcut buna karşın otomobil üreticileri biyodizelin traktörlerde kullanımılması gerektiğini savunuyor. Otomobilller için alternatif olarak hibrit ve elektrikli taşıtlar geleceğin teknolojisi olarak düşünülüyor.